產業布局不合理
整體而言，石油石化企業仍過多過散，帶來布局分散，市場掌控力不強，秩序混亂，管理難度加大。
在產業布局方面，由于歷史及區域經濟發展等原因，存在諸多不合理之處。東北、西北地區原油加工能力超過市場需求，成品油需要大量外運；而西南地區原油加工能力嚴重不足，成品油依靠長距離調入。
此外，相當一部分老企業隨著城市的發展已處于居住區包圍之中，存在較大的環境風險，需要進行搬遷改造。
資源短缺制約發展
我國原油短缺矛盾將長期存在，煉油裝置能力增長難以滿足國內乙烯工業對石腦油的需求，石化行業的資源性原料短缺矛盾日趨嚴重。
在乙烯方面，國內乙烯裂解原料以石腦油為主，與中東以乙烷為主的原料路線相比競爭力較弱。我國原油重質化趨勢明顯，化工輕油收率有限，還要考慮油品、乙烯與芳烴之間的平衡，從而直接影響到我國乙烯工業以及下游產業的總體競爭力和發展規模。
最近幾年出現的“氣荒”說明天然氣資源供需矛盾也已十分突出。根據《天然氣利用政策》，天然氣主要用于城市燃氣、工業燃料，在有余量的氣源地可用于氮肥生產。我國天然氣主要在中西部地區，遠離化肥消費市場；東部地區天然氣供應緊張，價格偏高，生產化肥經濟性較差。
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